24小时PH监测获得食管暴露于酸的时间与反流性食管炎严重性之间的相关性差，因此可认为食管粘膜防御功能的异常在反流性食管炎的致病中有一定作用。
正常人或GERD患者总会有胃液反流入食管，是否发生食管炎取决于食管粘膜与有害反流物这对矛盾的对抗结果。
胃排空延迟：反流性食管炎和胃排空延迟间的因素关系现在还有争论，但许多研究表明，胃排空延迟更易导致GER。胃的高酸状态：胃酸高分泌状态导致胃内容量和酸明显增加，是发生反流性食管炎的重要因素。食管清除分二步：第一步为容量清除，经1-2个蠕动性收缩使食管排空，但粘膜PH仍为酸性。第二步通过唾液（HCO3‐）缓冲作用中和残留酸。当食管蠕动减弱时，不能及时清除反流物，将可发生食管炎。